在2016年足協杯決賽首回合1比1收場后，恒大方面就當值主裁黃燁軍在比賽中的多次漏判誤判向中國足協提出了申訴。實際上，不僅恒大對黃燁軍的判罰不滿，蘇寧球員也對恒大的判罰不滿。但即便是足協時候給出主裁處罰，對黃燁軍來說也無關痛癢，因為他在今年將正式掛哨。

恒大方面為何對主裁黃燁軍的判罰不滿？第33分鐘，郜林殺入禁區被塞恩斯伯里從身后撞倒在地，而黃燁軍示意比賽繼續，恒大方面認為這是一個點球。下半場比賽，于漢超在禁區里遭對手侵犯，恒大方面應該判罰點球。與此同時，梅方在比賽中遭遇R馬的肘擊，導致眼睛傷腫。對于郜林被侵犯，裁判專家張大樵認為主裁應該判罰點球，這一漏判直接影響了比賽結果，問題比較嚴重。而對于梅方遭肘擊，張大樵稱：“黃燁軍應該吹隱蔽的犯規，結果他漏了。馬丁內斯動作很惡劣，裁判員應該給他出示紅牌，還應該給他追加處罰?！?/p>

恒大方面不滿，蘇寧的后衛周云的妻子在賽后也是表達了不滿，稱周云在比賽中遭到了對手的肘擊。從周云妻子提供的圖片來看，周云賽后在衛生間里出現了吐血的情況，眼睛也出現了淤青。

很明顯，無論是恒大還是蘇寧，都很在意這個冠軍。恒大方面，本賽季亞冠出局是個恥辱，他們需要拿到中超以及足協杯雙冠；蘇寧方面，他們希望成功衛冕，崔龍洙也希望拿到來到中國后的首冠。蘇寧通過本賽季的表現證明了他們有底氣和恒大叫板，但不希望是在裁判錯判漏判爭議判罰的情況下贏得比賽。

所以說，在事關冠軍的關鍵比賽中，裁判的一些因素還是要考慮到。要知道，黃燁軍今年已經45歲了，恒大主場對蘇寧的比賽是他職業生涯的最后一場比賽，即便足協事后給出處罰，對他也沒有任何作用了。

另外值得注意的是，這一場比賽的第四官員是范琦，他也會在本賽季結束后掛哨。對于恒大來說，范琦也曾給他們留下不好的印象。2015年足協杯第3輪，派出13人出戰客場的恒大挑戰新疆。第89分鐘，新疆外援禁區左側突破，李帥棄門出擊將其連人帶球放倒，范琦判罰點球。通過慢動作來看，李帥出擊時先撲到了球，隨后才帶倒對手，這個點球的判罰非常有爭議。恒大方面相當不滿，李帥因推搡范琦被紅牌罰下，助教馬達洛尼后來也被驅逐出場。恒大因為這個爭議點球，最終以1-2輸球出局。

此外，周剛和譚海也將在本賽季結束后掛哨。本賽季中超聯賽，蘇寧客場2比1擊敗上港，比賽結束后一瞬間，上港球員開始圍攻譚海，而后至少四百多名球迷將體育場裁判離開的通道圍住，高喊“黑哨”同時惡語相加，有的球迷甚至揮舞著鈔票去諷刺譚海。至于周剛，剛出道時遭時任中國足協裁委會副主任張大樵怒斥水平還不如香港裁判。2014賽季魯能擊敗國安一戰，戴琳和格隆發生沖突，周剛只罰下格隆引起不小爭議。